Europejski Trybunał Obrachunkowy – ETO (ang. European Court of Auditors) jest instytucją Unii Europejskiej, której głównym zadaniem jest kontrola wykonania unijnego budżetu. Realizacja tego zadania ma na celu zapewnienie lepszego zarządzania finansami Unii oraz informowanie obywateli o tym, w jaki sposób wydatkowane są publiczne środki. Siedzibą Europejskiego Trybunału Obrachunkowego jest Luksemburg.
Najwyższa Izba Kontroli od początku lat 90-tych realizowała model współpracy z Europejskim Trybunałem Obrachunkowym (ETO) podobny do zasad, jakie obowiązują przy współpracy ETO z NOK krajów członkowskich Unii Europejskiej. Przejawiało się to przede wszystkim w pomocy Europejskiemu Trybunałowi Obrachunkowemu podczas jego misji na terytorium Polski dotyczących kontroli środków Unii Europejskiej. Ponadto Najwyższa Izba Kontroli współpracowała ściśle z ETO przy realizacji własnej kontroli wykorzystania środków PHARE na współpracę transgraniczną. W innych kontrolach NIK dotyczących środków unijnych wykorzystywano informacje uzyskane w ramach współpracy z Europejskim Trybunałem Obrachunkowym.
Od 1999 r. współpraca z ETO przyjęła bardziej charakter szkoleniowy. Przy wsparciu funduszy Unii Europejskiej organizowane są dla pracowników NIK szkolenia dotyczące metodyki kontroli stosowanej przez Europejski Trybunał Obrachunkowy. Do ważniejszych przedsięwzięć szkoleniowych należy zaliczyć seminarium zorganizowane przy współudziale wykładowców z ETO, dotyczące europejskich wytycznych do spraw stosowania standardów INTOSAI, które odbyło się na początku 2000 r. Pod koniec 2000 r. odbyło się również szkolenie dla pracowników NIK prowadzone przez wykładowców z ETO na temat metodologii kontroli funduszy ISPA i SAPARD. W 1999 r. po raz pierwszy w historii Trybunału, pracownik NIK, przedstawiciel NOK z Europy Środkowo-Wschodniej odbył kilkumiesięczny staż w tej instytucji. Obecnie kolejny pracownik NIK przebywa na podobnym stażu.
W kontaktach z ETO duże znaczenie odgrywały spotkania Prezesa NIK z kolejnymi przewodniczącymi Europejskiego Trybunału Obrachunkowego. Ostatnie takie spotkanie miało miejsce w Luksemburgu w marcu 2001 r. Na tych spotkaniach oprócz założeń współpracy bilateralnej omawiane były kwestie współpracy NIK i ETO w regionie Europy Środkowej i Wschodniej. W zakresie tej współpracy wiodące znaczenie miało I Spotkanie Prezesów NOK Europy Środkowo-Wschodniej i ETO w marcu 1998 roku w Warszawie. W wyniku spotkania przyjęto dokument ramowy pt. “Deklaracja Prezesów NOK Państw Europy Środkowo-Wschodniej”, gdzie nakreślono tematykę i ustanowiono struktury służące dalszej współpracy w zakresie integracji europejskiej. Powołano Komitet Kontaktowy Prezesów NOK Europy Środkowo-Wschodniej i ETO oraz 2 Grupy Robocze. Powierzono NIK rolę przewodniczącego Grupy Roboczej ds. Funkcjonowania NOK w Kontekście Integracji Europejskiej”. Wynikiem jej pracy były “Zalecenia w sprawie Funkcjonowania NOK w kontekście integracji europejskiej” przyjęte przez prezesów NOK 15 krajów naszego regionu w 1999 r. w Pradze. Kolejne spotkania prezesów NOK tych krajów z przedstawicielami ETO miały miejsce w 2000 r. w Sofii oraz w 2001 r. na Cyprze.